Guía docente de la asignatura
(6281) GENÓMICA ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL

Curso académico 2024/2025

  1. Identificación

    1. De la asignatura

      2. Curso Académico
      2024/2025
      Titulación
      GRADO EN BIOTECNOLOGÍA
      Nombre de la asignatura
      GENÓMICA ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL
      Código
      6281
      Curso
      TERCERO
      Carácter
      OBLIGATORIA
      Número de grupos
      1
      Créditos ECTS
      6.0
      Estimación del volumen de trabajo
      150.0
      Organización temporal
      2º Cuatrimestre
      Idiomas en que se imparte
      Español
      Curso Académico 2024/2025
      Titulación

      GRADO EN BIOTECNOLOGÍA
      Nombre de la asignatura GENÓMICA ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL
      Código 6281
      Curso TERCERO
      Carácter OBLIGATORIA
      Número de grupos 1
      Créditos ECTS 6.0
      Estimación del volumen de trabajo 150.0
      Organización temporal 2º Cuatrimestre
      Idiomas en que se imparte Español

    2. Del profesorado: Equipo docente

      • GALBIS MARTINEZ, MARIA LUISA Docente: GRUPO 1 Coordinación de los grupos: GRUPO 1 Coordinador de la asignatura

        Categoría

        PROFESOR CONTRATADO DOCTOR TIPO A (DEI)

        Área

        GENÉTICA

        Departamento

        GENÉTICA Y MICROBIOLOGÍA

        Correo electrónico / Página web / Tutoría electrónica

        mgalbis@um.es Tutoría electrónica: Sí

        Teléfono, horario y lugar de atención al alumnado

        Duración:
        A         		Día:
        Lunes         		Horario:
        15:30-17:30         		Lugar:
        No consta
        Observaciones:
        No consta
        Duración:
        A         		Día:
        Martes         		Horario:
        15:30-17:30         		Lugar:
        No consta
        Observaciones:
        No consta
      • CARRILLO MARIN, PABLO Docente: GRUPO 1 Coordinación de los grupos:

        Categoría

        CONTRATADO/A PREDOCTORAL (FPU-MECD)

        Área

        No consta

        Departamento

        No consta

        Correo electrónico / Página web / Tutoría electrónica

        pablo.c.m2@um.es Tutoría electrónica: No

        Teléfono, horario y lugar de atención al alumnado

      • NAVARRO DEL SAZ, GABRIEL Docente: GRUPO 1 Coordinación de los grupos:

        Categoría

        CONTRATADO/A PREDOCTORAL (FPI-MINECO)

        Área

        GENÉTICA

        Departamento

        No consta

        Correo electrónico / Página web / Tutoría electrónica

        gabriel.navarro4@um.es Tutoría electrónica: No

        Teléfono, horario y lugar de atención al alumnado

      • NICOLAS MOLINA, FRANCISCO ESTEBAN Docente: GRUPO 1 Coordinación de los grupos:

        Categoría

        CATEDRATICOS DE UNIVERSIDAD

        Área

        GENÉTICA

        Departamento

        GENÉTICA Y MICROBIOLOGÍA

        Correo electrónico / Página web / Tutoría electrónica

        fnicolas@um.es Tutoría electrónica: Sí

        Teléfono, horario y lugar de atención al alumnado

        Duración:
        C1         		Día:
        Martes         		Horario:
        12:00-14:00         		Lugar:
        No consta
        Observaciones:
        No consta

  2. Presentación

    3. Son objetivos generales de la asignatura:

    1. Que el alumno comprenda los conceptos asociados a la Genómica estructural y funcional.

    2. Que el alumno conozca los tipos de secuencias que componen el genoma de los organismos y los procedimientos para conocer dichas secuencias.

    3. Que el alumno conozca cómo identificar genes en un contexto de secuencias.

    4. Que el alumno adquiera conocimientos de las metodologías y herramientas moleculares utilizadas para comparar los genomas de distintos organismos, así como conocer las aplicaciones derivadas de su comparación.

    5. Que el alumno conozca las herramientas moleculares que se utilizan hoy día para conocer la función de las secuencias codificantes y no codificantes presentes en el genoma de un organismo.

  3. Condiciones de acceso a la asignatura

    1. Incompatibilidades

      2. No constan

    2. Requisitos

      3. No constan

    3. Recomendaciones

      4. Se recomienda haber cursado con aprovechamiento las asignaturas de este mismo grado "Genética básica" de 1º curso e "Ingeniería Genética Molecular" de 3º curso.

  4. Contenidos

    1. Teoría

      2. Tema 1: Introducción: Genómica estructural y funcional.

      De la Genética Molecular a la Genómica. Concepto de Genómica. Genómica estructural y funcional. Primeros genomas secuenciados. El Proyecto Genoma Humano y proyectos derivados. Paleogenómica.

      Tema 2: Secuenciación de genomas.

      Estrategias básicas de secuenciación de un genoma. Principales técnicas de secuenciación. Metagenómica.

      Tema 3: Análisis de secuencias.

      Identificación de genes en organismos procarióticos. Identificación de genes en organismos eucarióticos. Estrategias intrínsecas y extrínsecas. Categorías de genes y grupos de genes ortólogos. Navegadores de genomas. Bases de datos de interés en Genómica.

      Tema 4: Anatomía de genomas.

      Tipos de secuencias y su distribución en genomas procarióticos. Tipos de secuencias y su distribución en genomas eucarióticos. Tipos de secuencias repetidas. RNAs no codificantes.

      Tema 5: El genoma humano.

      El Proyecto Genoma Humano. Los cromosomas humanos. Tipos de secuencias y distribución en el genoma humano. El Proyecto ENCODE. Variación genómica humana.

      Tema 6: Genómica comparada.

      Conceptos básicos en Genómica Comparada. Homología y sintenia. Genes parálogos y genes ortólogos. Aplicaciones de la Genómica Comparada. Búsqueda de similitudes y diferencias entre genomas. Árboles filogenéticos. Diferencias a nivel de la secuencia de nucleótidos entre genomas. Diferencias estructurales entre genomas. Paleogenómica.

      Tema 7: Genómica funcional. Transcriptómica.

      Genómica Funcional. Transcriptómica. Micromatrices de DNA. RNA-seq. Agrupación jerárquica de los datos. Aplicaciones de la transcriptómica. Análisis de la expresión génica. Transcriptómica comparada. Diagnóstico Molecular.

      Tema 8: Proteómica e Interactómica.

      Proteómica y métodos de análisis. Micromatrices de proteínas. Proteómica analítica. Proteómica funcional. Interactómica. Localizómica.

      Tema 9: Epigenómica.

      Estados de la cromatina. Remodelación de la cromatina. Modificaciones de histonas. Metilación del DNA. Epigenética. Epigenómica. Técnicas empleadas en epigenómica.

      Tema 10: Fenómica.

      Fenómica. Mutagénesis por inserción. Mutagénesis por deleción. Silenciamiento mediado por RNA (RNAi). Sistema CRISPR-Cas. Integración de datos ómicos.

    2. Prácticas

      • Práctica 1: P1. Visualización de genomas.

        Búsqueda de ORFs. Anotación de secuencias. Visualización de genomas mediante navegadores de genomas. Tipos de secuencias identificadas en el genoma.

        Relacionado con:
        • Tema 1: Introducción: Genómica estructural y funcional.
        • Tema 2: Secuenciación de genomas.
        • Tema 3: Análisis de secuencias.
        • Tema 4: Anatomía de genomas.

      • Práctica 2: P2. Secuenciación masiva de un genoma.

        Archivos obtenidos por secuenciación masiva. Localización de lecturas en un genoma de referencia. Identificación de variantes con respecto al genoma de referencia. Filtrado de variantes.

        Relacionado con:
        • Tema 1: Introducción: Genómica estructural y funcional.
        • Tema 2: Secuenciación de genomas.
        • Tema 3: Análisis de secuencias.
        • Tema 4: Anatomía de genomas.
        • Tema 6: Genómica comparada.

      • Práctica 3: P3. Variabilidad genómica humana. Relación con el diagnóstico genético.

        Variabilidad genómica humana. Ejemplo de secuenciación del exoma de un paciente. Estudio de posibles genes implicados. Categorías de variantes identificadas.

        Relacionado con:
        • Tema 1: Introducción: Genómica estructural y funcional.
        • Tema 2: Secuenciación de genomas.
        • Tema 3: Análisis de secuencias.
        • Tema 5: El genoma humano.
        • Tema 6: Genómica comparada.

      • Práctica 4: P4. Análisis de datos de RNA-seq y ChIP-seq

        Interpretación de resultados de experimentos de transcriptómica (RNA-seq) y epigenómica (ChIP-seq)

        Relacionado con:
        • Tema 1: Introducción: Genómica estructural y funcional.
        • Tema 2: Secuenciación de genomas.
        • Tema 7: Genómica funcional. Transcriptómica.
        • Tema 9: Epigenómica.

  5. Actividades Formativas

    6. Actividad Formativa Metodología Horas Presencialidad
    AF1: Exposición teórica / Clase magistral participativa.

    Actividades de clase expositiva. El contenido teórico de la asignatura se explicará al alumno de forma presencial, en clase, con el apoyo de presentaciones de Power Point (que serán depositadas en el Aula Virtual). En ellas se fomentará la participación del alumno y la discusión de las dudas que surjan durante el desarrollo de la clase. Además, se pondrá a disposición de los alumnos (en el Aula Virtual) un guión con un resumen de los contenidos y una selección bibliográfica pormenorizada.

    		 34.0 100.0
    AF2.2: Actividades prácticas de microaula

    Las prácticas son obligatorias. Las prácticas de microaula están diseñadas para completar y aplicar conocimientos adquiridos en las clases de teoría. La calificación de las prácticas se podrá conservar de un año a otro.

    		 14.0 100.0
    AF3: Seminarios / Resolución de problemas / Aprendizaje orientado a proyectos / Estudio de casos / Exposición y discusión de trabajos.

    En las sesiones de Seminarios los alumnos se organizarán en grupos de tres o cuatro, expondrán una presentación relacionada con la secuenciación del genoma de un organismo, y se discutirán algunas cuestiones relacionadas con él. Con suficiente antelación, el profesor entregará a los alumnos un artículo científico o la bibliografía adecuada para elaborar la presentación.

    		 6.0 100.0
    AF5: Tutorías: sesiones de orientación, revisión o apoyo a los alumnos por parte del profesor, programadas y realizadas de forma grupal o individual.

    Habrá tres sesiones de tutoría colectiva. En ellas se resolverán las dudas relacionadas con el contenido teórico de la asignatura, o con la actividad de Seminarios.

    		 3.0 100.0
    AF6: Evaluación: exámenes, exposiciones, entrevistas, controles, etc., ante la presencia del profesor o un tribunal evaluador, con la finalidad de evaluar las competencias adquiridas.

    1. Examen de teoría: Habrá un examen final escrito, con una calificación máxima de 70 puntos.

    2. Evaluación continua: Para evaluar el proceso de aprendizaje del alumno, se realizarán 2 controles escritos en horas de clase. Cada control puntuará sobre 5 puntos, por lo que la calificación máxima a obtener entre los dos controles será de 10 puntos.

    La puntuación en este apartado no es trasladable de un año a otro.

    		 3.0 100.0
    AF7: Trabajo autónomo: estudio y preparación de contenidos teóricos y prácticos, lectura, búsqueda y consulta bibliográfica, sistematización de contenidos, resolución de casos, planteamientos prácticos, resolución de problemas, preparación de trabajos o seminarios, exposiciones, preparación de informes, preparación de exámenes, etc. 90.0 0.0
    Totales 150,00

  6. Horario de la asignatura

    7. https://www.um.es/web/estudios/grados/biotecnologia/2024-25#horarios

  7. Sistemas de Evaluación

    8. Identificador Denominación del instrumento de evaluación Criterios de Valoración Ponderación
    SE1 Pruebas escritas (exámenes): pruebas objetivas, de desarrollo y/o de respuesta corta realizadas por los alumnos para mostrar los conocimientos teóricos y prácticos adquiridos.

    Examen final, escrito. El examen constará de dos partes. La primera será de tipo test y se puntuará sobre un total de 30 puntos.La segunda parte constará de situaciones experimentales, sobre las que el alumno deberá interpretar los resultados obtenidos o desarrollar un tema. Esta parte se puntuará sobre un máximo de 40 puntos.En la evaluación se tendrán en cuenta la claridad de la exposición, el uso correcto de los términos científicos, la claridad en el desarrollo y el uso correcto de las herramientas moleculares que el alumno haya utilizado para resolver las situaciones planteadas. El examen se puntuará sobre un máximo de 70 puntos.

    Habrá dos controles que se puntuarán con 5 puntos cada uno, pudiéndose obtener un máximo de 10 puntos en este apartado.

    Para superar la asignaturaserá necesario obtener al menos 50 puntos ,de los cuales 32 puntos deberán obtenerse en el examen, además de haber realizado las prácticas.

    		 80.0
    SE3 Presentación y defensa oral de trabajos y seminarios: exposición pública de trabajos y resultados, así como respuestas razonadas a las posibles cuestiones que se planteen sobre ellos.

    Los seminarios serán evaluados teniendo en cuenta la claridad y la estructura de la exposicón, el uso correcto de los términos científicos, la corrección y actualización de la información y el uso de las fuentes bibliográficas. También se evaluará la atención y la asistencia a estas sesiones. La puntuación máxima será de 10 puntos.

    		 10.0
    SE4 Ejecución de tareas prácticas: actividades de laboratorio o en aulas de informática para mostrar el saber hacer en la disciplina correspondiente

    Los exámenes de prácticas se puntuarán sobre un máximo total de 10 puntos.

    Para superar la asignatura, es necesario haber realizado las prácticas.

    La calificación de las prácticas se podrá conservar de un año a otro.

    		 10.0

  8. Fechas de exámenes

    9. https://www.um.es/web/estudios/grados/biotecnologia/2024-25#examenes

    Resultados del Aprendizaje

    • RA1 (Conocimientos o contenidos): Adquirir y comprender conocimientos en un área de estudio que parte de la base de la educación secundaria general, y se suele encontrar a un nivel que, si bien se apoya en libros de texto avanzados, incluye también algunos aspectos que implican conocimientos procedentes de la vanguardia de su campo de estudio.
    • RA2 (Competencias): Aplicar sus conocimientos a su trabajo o vocación de una forma profesional y poseer las competencias que suelen demostrarse por medio de la elaboración y defensa de argumentos y la resolución de problemas dentro de su área de estudio.
    • RA3 (Habilidades o destrezas): Reunir e interpretar datos relevantes (normalmente dentro de su área de estudio) para emitir juicios que incluyan una reflexión sobre temas relevantes de índole social, científica o ética.
    • RA4 (Competencias): Transmitir información, ideas, problemas y soluciones a un público tanto especializado como no especializado.
    • RA5 (Habilidades o destrezas): Desarrollar habilidades de aprendizaje necesarias para emprender estudios posteriores con un alto grado de autonomía.
    • RA6 (Conocimientos o contenidos): Expresarse correctamente en lengua castellana en su ámbito disciplinar
    • RA7 (Conocimientos o contenidos): Comprender y expresarse en un idioma extranjero en su ámbito disciplinar, particularmente el inglés
    • RA8 (Competencias): Gestionar la información y el conocimiento en su ámbito disciplinar, incluyendo saber utilizar como usuario las herramientas básicas en TIC.
    • RA9 (Competencias): Considerar la ética y la integridad intelectual como valores esenciales de la práctica profesional.
    • RA11 (Habilidades o destrezas): Trabajar en equipo y relacionarse con otras personas del mismo o distinto ámbito profesional
    • RA12 (Competencias): Desarrollar habilidades de iniciación a la investigación
    • RA13 (Competencias): Trabajar de forma adecuada en un laboratorio con material biológico (bacterias, hongos, virus, células animales y vegetales, plantas, animales) incluyendo seguridad, manipulación y eliminación de residuos biológicos y registro anotado de actividades.
    • RA14 (Competencias): Trabajar de forma adecuada en un laboratorio químico-bioquímico incluyendo seguridad, manipulación y eliminación de residuos químicos y registro anotado de actividades.
    • RA15 (Habilidades o destrezas): Pensar de una forma integrada y abordar los problemas desde diferentes perspectivas.
    • RA16 (Habilidades o destrezas): Interpretar resultados experimentales e identificar elementos consistentes e inconsistentes.
    • RA17 (Conocimientos o contenidos): Diseñar experimentos y comprender las limitaciones de la aproximación experimental
    • RA18 (Conocimientos o contenidos): Conocer el funcionamiento celular, tanto del metabolismo como de la expresión génica, pudiendo relacionar la actividad de los diferentes compartimentos celulares.
    • RA19 (Competencias): Buscar y obtener la información de las principales bases de datos biológicos: genómicos, transcriptómicos, proteómicos, metabolómicos, datos bibliográficos, etc., y usar las herramientas bioinformáticas básicas.
    • RA23 (Conocimientos o contenidos): Conocer las estrategias de producción y mejora de productos por métodos biotecnológicos.
    • RA25 (Conocimientos o contenidos): Conocer los fundamentos del proceso de I+D+i.
    • RA28 (Conocimientos o contenidos): Conocer los elementos fundamentales de la comunicación y percepción pública de las innovaciones biotecnológicas y de los riesgos asociados a ellas.

  9. Bibliografía

    10. Grupo: GRUPO 1

  10. Observaciones

    11. NECESIDADES EDUCATIVAS ESPECIALES: Aquellos estudiantes con discapacidad o necesidades educativas especiales podrán dirigirse al Servicio de Atención a la Diversidad y Voluntariado (ADYV; http://wwwumes/adyv) para recibir orientación sobre un mejor aprovechamiento de su proceso formativo y, en su caso, la adopción de medidas de equiparación y de mejora para la inclusión, en virtud de la Resolución Rectoral R-358/2016 El tratamiento de la información sobre este alumnado, en cumplimiento con la LOPD, es de estricta confidencialidad.

    Esta asignatura se encuentra vinculada de forma directa con los Objetivos de Desarrollo Sostenible: nº 3 (Salud y bienestar) y nº 9 (Industria, innovación e infraestructura)

    NECESIDADES EDUCATIVAS ESPECIALES

    Aquellos estudiantes con discapacidad o necesidades educativas especiales podrán dirigirse al Servicio de Atención a la Diversidad y Voluntariado (ADYV - https://www.um.es/adyv) para recibir orientación sobre un mejor aprovechamiento de su proceso formativo y, en su caso, la adopción de medidas de equiparación y de mejora para la inclusión, en virtud de la Resolución Rectoral R-358/2016. El tratamiento de la información sobre este alumnado, en cumplimiento con la LOPD, es de estricta confidencialidad.

    REGLAMENTO DE EVALUACIÓN DE ESTUDIANTES

    El artículo 8.6 del Reglamento de Evaluación de Estudiantes (REVA) prevé que "salvo en el caso de actividades definidas como obligatorias en la guía docente, si el o la estudiante no puede seguir el proceso de evaluación continua por circunstancias sobrevenidas debidamente justificadas, tendrá derecho a realizar una prueba global".

    Se recuerda asimismo que el artículo 22.1 del Reglamento de Evaluación de Estudiantes (REVA) estipula que "el o la estudiante que se valga de conductas fraudulentas, incluida la indebida atribución de identidad o autoría, o esté en posesión de medios o instrumentos que faciliten dichas conductas, obtendrá la calificación de cero en el procedimiento de evaluación y, en su caso, podrá ser objeto de sanción, previa apertura de expediente disciplinario".